Πριν χρησιμοποιήσετε έναν αποτεφρωτή απορριμμάτων, τα απόβλητα θα πρέπει να ταξινομούνται αυστηρά για να αποφευχθεί η προσθήκη εύφλεκτων, εκρηκτικών, μεταλλικών ή μεγάλων λίθων και άλλων ακατάλληλων υλικών. Η ποσότητα των απορριμμάτων που τροφοδοτούνται θα πρέπει να ελέγχεται εύλογα σύμφωνα με την ικανότητα σχεδιασμού του εξοπλισμού για να αποφευχθεί η ατελής καύση ή η υπερφόρτωση του εξοπλισμού λόγω υπερβολικής τροφοδοσίας ταυτόχρονα. Οι μικροί ή κινητοί αποτεφρωτήρες θα πρέπει να τροφοδοτούνται σε παρτίδες για να εξασφαλίζεται ομοιόμορφη θερμοκρασία καύσης και απόδοση.
Κατά την εκκίνηση του εξοπλισμού, θα πρέπει να εκτελείται προθέρμανση για να διασφαλιστεί ότι ο κλίβανος φτάνει σε σταθερή υψηλή θερμοκρασία. Κατά τη διάρκεια της καύσης, θα πρέπει να δοθεί προσοχή στη ρύθμιση της ροής αέρα και της ταχύτητας καύσης για να διασφαλιστεί η πλήρης καύση των απορριμμάτων σε περιβάλλον υψηλής θερμοκρασίας. Η ροή αέρα του ανεμιστήρα και ο χρόνος καύσης μπορούν να ρυθμιστούν κατάλληλα ανάλογα με την υγρασία και τον τύπο των απορριμμάτων για να διασφαλιστεί η πλήρης οξείδωση των απορριμμάτων, ενώ παράλληλα μειώνεται ο κίνδυνος παραγωγής καυσαερίων και δευτερογενούς ρύπανσης.
Κατά τη λειτουργία, ο κλίβανος, οι σωλήνες εξάτμισης, το σύστημα ελέγχου καύσης και η συσκευή καθαρισμού των καυσαερίων θα πρέπει να επιθεωρούνται τακτικά για να διασφαλίζεται η κανονική λειτουργία. Μετά από κάθε λειτουργία, τα υπολείμματα του κλιβάνου, η τέφρα ψύξης και η συσσωρευμένη τέφρα στον κάδο τέφρας θα πρέπει να καθαρίζονται για να αποφευχθεί η απόφραξη ή η υπερβολική συσσώρευση τέφρας που θα μπορούσε να επηρεάσει την επόμενη απόδοση καύσης. Για συστήματα καθαρισμού καυσαερίων, η κατάσταση λειτουργίας των φίλτρου, των συλλεκτών σκόνης και των συσκευών προσρόφησης ενεργού άνθρακα θα πρέπει να ελέγχεται τακτικά για να διασφαλίζεται ότι οι εκπομπές πληρούν τα πρότυπα. Οι χειριστές πρέπει να τηρούν αυστηρά τις διαδικασίες ασφαλείας και να φορούν τον απαραίτητο προστατευτικό εξοπλισμό, όπως γάντια, μάσκες και γυαλιά ασφαλείας. Οι συσκευές διακοπής λειτουργίας έκτακτης ανάγκης, τα συστήματα συναγερμού θερμοκρασίας και πίεσης στον εξοπλισμό πρέπει να διατηρούνται σε καλή κατάσταση λειτουργίας.